#/bin/tcsh
cd $file
rDcavity -r $file.prm -was
rDock -i $file\_l.sd -r $file.prm -o $file\_test -p dock.prm -n 50
rDrms $file\_c.sd $file\_test.sd $file\_rms.sd
sdsort -fSCORE -r $file\_rms.sd > $file\_sorted.sd
cd ../
