Here is a list of all documented class members with links to the class documentation for each member:

- a -

• atom() : clipper::MAtom , clipper::MAtomIndex
• atom_list() : clipper::MPolymer , clipper::MMonomer , clipper::MModel
• atoms_near() : clipper::MAtomNonBond

- c -

• cell() : clipper::MiniMol
• CMiniMol() : clipper::CMiniMol
• coord_orth() : clipper::MAtom
• copy() : clipper::MAtom , clipper::MModel , clipper::MPolymer , clipper::MMonomer

- e -

• element() : clipper::MAtom
• export_minimol() : clipper::MMDBfile

- f -

• find() : clipper::MMonomer , clipper::MMoleculeSequence , clipper::MModel , clipper::MPolymer , clipper::MMonomer

- i -

• id() : clipper::MAtom , clipper::MMonomer , clipper::MPolymerSequence , clipper::MPolymer
• id_match() : clipper::MPolymerSequence , clipper::MAtom , clipper::MMonomer , clipper::MPolymer
• id_tidy() : clipper::MAtom , clipper::MMonomer , clipper::MPolymer , clipper::MPolymerSequence
• import_minimol() : clipper::MMDBfile
• import_molecule_sequence() : clipper::SEQfile
• import_polymer_sequence() : clipper::SEQfile
• init() : clipper::CMiniMol , clipper::MiniMol
• insert() : clipper::MMonomer , clipper::MModel , clipper::MMoleculeSequence , clipper::MPolymer
• is_null() : clipper::MAtomIndex , clipper::MMoleculeSequence , clipper::MiniMol

- l -

• lookup() : clipper::MMonomer , clipper::MMoleculeSequence , clipper::MModel , clipper::MPolymer

- m -

• MAtom() : clipper::MAtom
• MAtomIndex() : clipper::MAtomIndex
• MAtomIndexSymmetry() : clipper::MAtomIndexSymmetry
• MAtomNonBond() : clipper::MAtomNonBond
• MiniMol() : clipper::MiniMol
• model() : clipper::MiniMol
• monomer() : clipper::MAtomIndex
• MPolymerSequence() : clipper::MPolymerSequence

- n -

• name() : clipper::MAtom

- o -

• occupancy() : clipper::MAtom
• operator& : clipper::MMonomer , clipper::MModel , clipper::MPolymer
• operator()() : clipper::MAtomNonBond
• operator[]() : clipper::MMoleculeSequence , clipper::MModel , clipper::MPolymer , clipper::MModel , clipper::MMonomer , clipper::MMoleculeSequence , clipper::MMonomer
• operator| : clipper::MPolymer , clipper::MMonomer , clipper::MModel

- p -

• polymer() : clipper::MAtomIndex
• protein_mainchain_build_carbonyl_oxygen() : clipper::MMonomer
• protein_peptide_bond() : clipper::MMonomer
• protein_ramachandran_phi() : clipper::MMonomer
• protein_ramachandran_psi() : clipper::MMonomer
• protein_sidechain_build_rotamer() : clipper::MMonomer
• protein_sidechain_number_of_rotamers() : clipper::MMonomer

- r -

• read_file() : clipper::MMDBfile , clipper::SEQfile

- s -

• select() : clipper::MMonomer , clipper::MPolymer , clipper::MModel
• seqnum() : clipper::MMonomer
• sequence() : clipper::MPolymerSequence
• set_coord_orth() : clipper::MAtom
• set_element() : clipper::MAtom
• set_id() : clipper::MAtom , clipper::MMonomer , clipper::MPolymer , clipper::MPolymerSequence
• set_name() : clipper::MAtom
• set_occupancy() : clipper::MAtom
• set_seqnum() : clipper::MMonomer
• set_sequence() : clipper::MPolymerSequence
• set_type() : clipper::MMonomer
• set_u_aniso_orth() : clipper::MAtom
• set_u_iso() : clipper::MAtom
• size() : clipper::MMonomer , clipper::MModel , clipper::MMoleculeSequence , clipper::MPolymer
• spacegroup() : clipper::MiniMol
• symmetry() : clipper::MAtomIndexSymmetry

- t -

• transform() : clipper::MAtom , clipper::MMonomer , clipper::MModel , clipper::MPolymer
• type() : clipper::MMonomer
• TYPE : clipper::MMonomer

- u -

• u_aniso_orth() : clipper::MAtom
• u_iso() : clipper::MAtom
• update() : clipper::CMiniMol

- w -

• write_file() : clipper::MMDBfile